- Vertina, kaip Departamentas, jam pavaldūs viešieji juridiniai asmenys:
- laikosi veiklą reglamentuojančių teisės aktų reikalavimų;
- įgyvendina strateginius planavimo dokumentus;
- vykdo veiklą ekonomiškumo, efektyvumo ir rezultatyvumo požiūriu;
- valdo riziką: nustato, analizuoja rizikos veiksnius ir parenka priemones, kurios sumažintų arba pašalintų neigiamą poveikį viešojo juridinio asmens veiklai;
- valdo, naudoja turtą ir disponuoja juo, saugo jį nuo neteisėtų veikų, atlieka turto apskaitą;
- užtikrina teikiamos informacijos apie finansinę ir kitą veiklą patikimumą, aktualumą, išsamumą ir teisingumą;
- užtikrina informacinių sistemų valdymą ir saugumą;
- vertina viešojo juridinio asmens, jam pavaldžių viešųjų juridinių asmenų gautų Europos Sąjungos ir (arba) tarptautinės finansinės paramos lėšų panaudojimo administravimą, teikia išvadas ir rekomendacijas dėl jo tobulinimo;
- atlieka korupcijos rizikos valdymovertinimą;
- rengia vidaus audito ataskaitas, kuriose teikia išvadas ir rekomendacijas dėl Departamento, jam pavaldžių viešųjų juridinių asmenų valdymo, rizikos valdymo ir vidaus kontrolės tobulinimo;
- atlieka pažangos stebėjimą: stebi ir vertina, kaip įgyvendinamos vidaus audito ataskaitoje pateiktos rekomendacijos;
- rengia ir teikia konsultacijas Departamento valdymo, rizikos valdymo ir vidaus kontrolės klausimais Departamento direktoriui, Departamento administracijos padalinių ir (ar) viešajam juridiniam asmeniui pavaldžių viešųjų juridinių asmenų vadovams;
- rengia Skyriaus veiklos planus ir metinę Skyriaus veiklos ataskaitą;
- atlieka kitas teisės aktuose nurodytas funkcijas, susijusias su Skyriaus veiklos tikslo įgyvendinimu.